Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms