Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms