Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms