Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
KDM5CP41229 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.86
KDM5CP41229 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
KDM5CP41229 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
KDM5CP41229 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
KDM5CP41229 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KDM5CP41229 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
KDM5CP41229 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KDM5CP41229 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
KDM5CP41229 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KDM5CP41229 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
KDM5CP41229 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
KDM5CP41229 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KDM5CP41229 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
KDM5CP41229 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
KDM5CP41229 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
KDM5CP41229 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
KDM5CP41229 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
KDM5CP41229 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
KDM5CP41229 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
KDM5CP41229 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
KDM5CP41229 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
KDM5CP41229 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
KDM5CP41229 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
KDM5CP41229 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
KDM5CP41229 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms