Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THPOP40225 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THPOP40225 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THPOP40225 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THPOP40225 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
THPOP40225 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
THPOP40225 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
THPOP40225 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
THPOP40225 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
THPOP40225 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
THPOP40225 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
THPOP40225 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
THPOP40225 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
THPOP40225 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
THPOP40225 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
THPOP40225 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
THPOP40225 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
THPOP40225 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THPOP40225 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
THPOP40225 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
THPOP40225 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
THPOP40225 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
THPOP40225 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THPOP40225 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THPOP40225 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THPOP40225 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THPOP40225 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THPOP40225 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THPOP40225 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
THPOP40225 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THPOP40225 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THPOP40225 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THPOP40225 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
THPOP40225 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THPOP40225 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THPOP40225 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THPOP40225 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
THPOP40225 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THPOP40225 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THPOP40225 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THPOP40225 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
THPOP40225 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
THPOP40225 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
THPOP40225 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
THPOP40225 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THPOP40225 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THPOP40225 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THPOP40225 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
THPOP40225 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THPOP40225 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THPOP40225 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
THPOP40225 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THPOP40225 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THPOP40225 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THPOP40225 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THPOP40225 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THPOP40225 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THPOP40225 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
THPOP40225 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THPOP40225 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THPOP40225 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THPOP40225 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
THPOP40225 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THPOP40225 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THPOP40225 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THPOP40225 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
THPOP40225 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
THPOP40225 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
THPOP40225 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
THPOP40225 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
THPOP40225 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
THPOP40225 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
THPOP40225 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
THPOP40225 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
THPOP40225 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
THPOP40225 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
THPOP40225 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
THPOP40225 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
THPOP40225 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
THPOP40225 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
THPOP40225 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
THPOP40225 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
THPOP40225 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
THPOP40225 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
THPOP40225 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THPOP40225 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
THPOP40225 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
THPOP40225 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THPOP40225 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THPOP40225 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
THPOP40225 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THPOP40225 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
THPOP40225 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THPOP40225 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
THPOP40225 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THPOP40225 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THPOP40225 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THPOP40225 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THPOP40225 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THPOP40225 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms