Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPL4P36578 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPL4P36578 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPL4P36578 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPL4P36578 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPL4P36578 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPL4P36578 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPL4P36578 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPL4P36578 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPL4P36578 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPL4P36578 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RPL4P36578 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPL4P36578 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPL4P36578 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPL4P36578 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPL4P36578 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPL4P36578 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPL4P36578 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPL4P36578 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPL4P36578 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPL4P36578 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPL4P36578 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPL4P36578 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPL4P36578 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPL4P36578 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPL4P36578 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPL4P36578 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL4P36578 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL4P36578 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL4P36578 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL4P36578 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL4P36578 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL4P36578 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL4P36578 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL4P36578 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL4P36578 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL4P36578 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL4P36578 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL4P36578 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL4P36578 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL4P36578 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL4P36578 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL4P36578 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL4P36578 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL4P36578 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL4P36578 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL4P36578 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL4P36578 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL4P36578 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL4P36578 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL4P36578 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL4P36578 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL4P36578 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL4P36578 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL4P36578 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL4P36578 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL4P36578 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL4P36578 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL4P36578 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL4P36578 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL4P36578 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL4P36578 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL4P36578 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL4P36578 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL4P36578 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL4P36578 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL4P36578 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL4P36578 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL4P36578 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL4P36578 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL4P36578 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL4P36578 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL4P36578 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL4P36578 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL4P36578 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL4P36578 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL4P36578 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL4P36578 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL4P36578 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL4P36578 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL4P36578 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL4P36578 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL4P36578 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL4P36578 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL4P36578 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL4P36578 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL4P36578 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL4P36578 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL4P36578 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL4P36578 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL4P36578 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL4P36578 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL4P36578 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL4P36578 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL4P36578 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL4P36578 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL4P36578 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL4P36578 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL4P36578 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL4P36578 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms