Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE6BP35913 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE6BP35913 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE6BP35913 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms