Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT9P35527 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT9P35527 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT9P35527 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT9P35527 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT9P35527 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT9P35527 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT9P35527 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT9P35527 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT9P35527 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT9P35527 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT9P35527 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT9P35527 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT9P35527 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT9P35527 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT9P35527 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT9P35527 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT9P35527 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT9P35527 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT9P35527 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT9P35527 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT9P35527 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT9P35527 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT9P35527 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT9P35527 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT9P35527 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT9P35527 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT9P35527 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT9P35527 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT9P35527 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT9P35527 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT9P35527 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT9P35527 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT9P35527 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT9P35527 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT9P35527 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT9P35527 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT9P35527 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT9P35527 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT9P35527 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT9P35527 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT9P35527 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT9P35527 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT9P35527 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT9P35527 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT9P35527 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT9P35527 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT9P35527 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT9P35527 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT9P35527 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT9P35527 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT9P35527 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT9P35527 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT9P35527 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT9P35527 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT9P35527 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT9P35527 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT9P35527 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT9P35527 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT9P35527 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT9P35527 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT9P35527 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT9P35527 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT9P35527 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT9P35527 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT9P35527 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT9P35527 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT9P35527 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT9P35527 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT9P35527 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT9P35527 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT9P35527 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT9P35527 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT9P35527 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT9P35527 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT9P35527 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT9P35527 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT9P35527 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT9P35527 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT9P35527 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT9P35527 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT9P35527 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT9P35527 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT9P35527 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT9P35527 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT9P35527 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT9P35527 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT9P35527 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT9P35527 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT9P35527 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT9P35527 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT9P35527 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT9P35527 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT9P35527 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT9P35527 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT9P35527 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT9P35527 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT9P35527 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT9P35527 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT9P35527 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms