Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL9P32969 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL9P32969 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL9P32969 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL9P32969 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL9P32969 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL9P32969 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL9P32969 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL9P32969 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL9P32969 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL9P32969 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL9P32969 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL9P32969 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL9P32969 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL9P32969 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL9P32969 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL9P32969 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL9P32969 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL9P32969 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL9P32969 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL9P32969 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL9P32969 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL9P32969 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL9P32969 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL9P32969 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL9P32969 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL9P32969 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL9P32969 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL9P32969 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RPL9P32969 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL9P32969 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL9P32969 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL9P32969 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL9P32969 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL9P32969 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL9P32969 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL9P32969 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL9P32969 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL9P32969 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL9P32969 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL9P32969 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL9P32969 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL9P32969 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL9P32969 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL9P32969 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL9P32969 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL9P32969 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL9P32969 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL9P32969 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL9P32969 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL9P32969 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL9P32969 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL9P32969 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL9P32969 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL9P32969 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL9P32969 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL9P32969 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL9P32969 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL9P32969 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL9P32969 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL9P32969 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL9P32969 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL9P32969 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL9P32969 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL9P32969 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL9P32969 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL9P32969 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL9P32969 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL9P32969 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL9P32969 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL9P32969 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL9P32969 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL9P32969 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL9P32969 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL9P32969 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL9P32969 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL9P32969 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL9P32969 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL9P32969 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL9P32969 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL9P32969 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL9P32969 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL9P32969 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL9P32969 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL9P32969 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL9P32969 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL9P32969 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL9P32969 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL9P32969 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL9P32969 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL9P32969 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL9P32969 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL9P32969 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL9P32969 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL9P32969 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL9P32969 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL9P32969 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL9P32969 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL9P32969 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL9P32969 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms