Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MIPP30301 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIPP30301 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIPP30301 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIPP30301 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIPP30301 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIPP30301 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIPP30301 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIPP30301 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIPP30301 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIPP30301 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIPP30301 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIPP30301 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIPP30301 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIPP30301 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIPP30301 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MIPP30301 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIPP30301 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIPP30301 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIPP30301 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIPP30301 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIPP30301 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIPP30301 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIPP30301 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIPP30301 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIPP30301 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIPP30301 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIPP30301 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIPP30301 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIPP30301 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIPP30301 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIPP30301 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MIPP30301 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIPP30301 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIPP30301 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIPP30301 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIPP30301 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MIPP30301 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MIPP30301 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIPP30301 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIPP30301 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIPP30301 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIPP30301 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIPP30301 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIPP30301 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIPP30301 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIPP30301 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIPP30301 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIPP30301 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIPP30301 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIPP30301 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIPP30301 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIPP30301 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIPP30301 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIPP30301 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIPP30301 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIPP30301 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIPP30301 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIPP30301 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIPP30301 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIPP30301 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIPP30301 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIPP30301 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIPP30301 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIPP30301 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIPP30301 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIPP30301 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIPP30301 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIPP30301 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIPP30301 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIPP30301 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIPP30301 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIPP30301 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIPP30301 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIPP30301 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIPP30301 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIPP30301 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MIPP30301 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MIPP30301 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIPP30301 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MIPP30301 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MIPP30301 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIPP30301 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIPP30301 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIPP30301 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIPP30301 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIPP30301 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIPP30301 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIPP30301 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIPP30301 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIPP30301 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIPP30301 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIPP30301 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MIPP30301 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MIPP30301 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MIPP30301 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MIPP30301 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MIPP30301 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MIPP30301 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MIPP30301 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms