Protein–RNA interactions for Protein: P25940

COL5A3, Collagen alpha-3(V) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A3P25940 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL5A3P25940 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL5A3P25940 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms