Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms