Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPREP23469 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPREP23469 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPREP23469 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPREP23469 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPREP23469 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPREP23469 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPREP23469 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPREP23469 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPREP23469 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPREP23469 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPREP23469 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPREP23469 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPREP23469 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPREP23469 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPREP23469 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPREP23469 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPREP23469 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPREP23469 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPREP23469 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPREP23469 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPREP23469 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPREP23469 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPREP23469 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPREP23469 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPREP23469 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPREP23469 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPREP23469 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPREP23469 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPREP23469 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPREP23469 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPREP23469 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPREP23469 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPREP23469 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPREP23469 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPREP23469 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPREP23469 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPREP23469 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPREP23469 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPREP23469 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPREP23469 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPREP23469 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPREP23469 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPREP23469 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPREP23469 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPREP23469 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPREP23469 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPREP23469 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPREP23469 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPREP23469 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPREP23469 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPREP23469 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPREP23469 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPREP23469 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPREP23469 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPREP23469 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPREP23469 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPREP23469 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPREP23469 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPREP23469 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPREP23469 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPREP23469 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPREP23469 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPREP23469 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPREP23469 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPREP23469 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPREP23469 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPREP23469 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPREP23469 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPREP23469 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPREP23469 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPREP23469 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPREP23469 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPREP23469 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPREP23469 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPREP23469 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPREP23469 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPREP23469 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPREP23469 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPREP23469 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPREP23469 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPREP23469 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPREP23469 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPREP23469 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPREP23469 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPREP23469 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPREP23469 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPREP23469 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPREP23469 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPREP23469 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPREP23469 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPREP23469 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPREP23469 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPREP23469 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPREP23469 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPREP23469 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPREP23469 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPREP23469 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPREP23469 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPREP23469 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms