Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX1P22670 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX1P22670 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX1P22670 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX1P22670 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX1P22670 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX1P22670 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFX1P22670 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFX1P22670 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RFX1P22670 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFX1P22670 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFX1P22670 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFX1P22670 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFX1P22670 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFX1P22670 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFX1P22670 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFX1P22670 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFX1P22670 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RFX1P22670 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFX1P22670 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFX1P22670 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFX1P22670 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFX1P22670 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX1P22670 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX1P22670 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX1P22670 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX1P22670 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX1P22670 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX1P22670 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX1P22670 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX1P22670 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX1P22670 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX1P22670 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX1P22670 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX1P22670 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX1P22670 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX1P22670 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX1P22670 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX1P22670 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX1P22670 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX1P22670 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX1P22670 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX1P22670 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX1P22670 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX1P22670 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX1P22670 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX1P22670 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX1P22670 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX1P22670 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX1P22670 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX1P22670 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX1P22670 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX1P22670 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX1P22670 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX1P22670 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX1P22670 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX1P22670 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX1P22670 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX1P22670 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX1P22670 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX1P22670 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX1P22670 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX1P22670 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX1P22670 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX1P22670 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX1P22670 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX1P22670 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX1P22670 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX1P22670 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX1P22670 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX1P22670 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX1P22670 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX1P22670 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX1P22670 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX1P22670 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX1P22670 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX1P22670 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX1P22670 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX1P22670 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX1P22670 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX1P22670 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX1P22670 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX1P22670 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX1P22670 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX1P22670 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX1P22670 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX1P22670 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX1P22670 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX1P22670 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX1P22670 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX1P22670 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX1P22670 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFX1P22670 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFX1P22670 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFX1P22670 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFX1P22670 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFX1P22670 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RFX1P22670 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFX1P22670 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFX1P22670 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms