Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FLT1P17948 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FLT1P17948 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FLT1P17948 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FLT1P17948 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FLT1P17948 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FLT1P17948 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FLT1P17948 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FLT1P17948 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FLT1P17948 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FLT1P17948 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FLT1P17948 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
FLT1P17948 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FLT1P17948 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FLT1P17948 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FLT1P17948 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FLT1P17948 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FLT1P17948 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FLT1P17948 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FLT1P17948 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FLT1P17948 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FLT1P17948 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FLT1P17948 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FLT1P17948 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FLT1P17948 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FLT1P17948 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FLT1P17948 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FLT1P17948 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FLT1P17948 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FLT1P17948 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FLT1P17948 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FLT1P17948 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FLT1P17948 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FLT1P17948 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FLT1P17948 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FLT1P17948 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FLT1P17948 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FLT1P17948 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FLT1P17948 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FLT1P17948 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FLT1P17948 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FLT1P17948 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FLT1P17948 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FLT1P17948 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FLT1P17948 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FLT1P17948 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FLT1P17948 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FLT1P17948 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FLT1P17948 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLT1P17948 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLT1P17948 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLT1P17948 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLT1P17948 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLT1P17948 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLT1P17948 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLT1P17948 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLT1P17948 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLT1P17948 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLT1P17948 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLT1P17948 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLT1P17948 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLT1P17948 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLT1P17948 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLT1P17948 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FLT1P17948 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FLT1P17948 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FLT1P17948 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FLT1P17948 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FLT1P17948 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FLT1P17948 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FLT1P17948 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FLT1P17948 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FLT1P17948 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FLT1P17948 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FLT1P17948 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FLT1P17948 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FLT1P17948 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FLT1P17948 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FLT1P17948 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FLT1P17948 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT1P17948 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT1P17948 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT1P17948 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT1P17948 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT1P17948 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT1P17948 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT1P17948 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FLT1P17948 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FLT1P17948 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FLT1P17948 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FLT1P17948 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FLT1P17948 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FLT1P17948 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FLT1P17948 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FLT1P17948 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FLT1P17948 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FLT1P17948 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FLT1P17948 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FLT1P17948 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FLT1P17948 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms