Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN2P17655 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms