Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF3P17036 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF3P17036 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF3P17036 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF3P17036 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF3P17036 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF3P17036 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF3P17036 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF3P17036 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF3P17036 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF3P17036 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF3P17036 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF3P17036 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF3P17036 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF3P17036 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF3P17036 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF3P17036 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF3P17036 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF3P17036 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF3P17036 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF3P17036 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF3P17036 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms