Protein–RNA interactions for Protein: P00338

LDHA, L-lactate dehydrogenase A chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHAP00338 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LDHAP00338 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LDHAP00338 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LDHAP00338 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LDHAP00338 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LDHAP00338 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LDHAP00338 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LDHAP00338 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LDHAP00338 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDHAP00338 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDHAP00338 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDHAP00338 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDHAP00338 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDHAP00338 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDHAP00338 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDHAP00338 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDHAP00338 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDHAP00338 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDHAP00338 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDHAP00338 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDHAP00338 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDHAP00338 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDHAP00338 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDHAP00338 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LDHAP00338 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDHAP00338 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDHAP00338 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDHAP00338 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDHAP00338 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDHAP00338 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LDHAP00338 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDHAP00338 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDHAP00338 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDHAP00338 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDHAP00338 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDHAP00338 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDHAP00338 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDHAP00338 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDHAP00338 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHAP00338 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHAP00338 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHAP00338 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHAP00338 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHAP00338 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHAP00338 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHAP00338 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHAP00338 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHAP00338 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHAP00338 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHAP00338 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHAP00338 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHAP00338 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHAP00338 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHAP00338 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHAP00338 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDHAP00338 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDHAP00338 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LDHAP00338 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDHAP00338 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDHAP00338 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDHAP00338 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDHAP00338 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDHAP00338 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDHAP00338 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDHAP00338 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDHAP00338 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LDHAP00338 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDHAP00338 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDHAP00338 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDHAP00338 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHAP00338 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHAP00338 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHAP00338 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHAP00338 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHAP00338 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHAP00338 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHAP00338 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHAP00338 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHAP00338 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHAP00338 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHAP00338 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHAP00338 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHAP00338 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHAP00338 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHAP00338 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHAP00338 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHAP00338 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDHAP00338 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDHAP00338 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDHAP00338 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDHAP00338 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDHAP00338 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDHAP00338 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDHAP00338 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDHAP00338 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDHAP00338 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDHAP00338 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LDHAP00338 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LDHAP00338 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDHAP00338 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms