Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NSD2O96028 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NSD2O96028 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NSD2O96028 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NSD2O96028 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NSD2O96028 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NSD2O96028 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NSD2O96028 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NSD2O96028 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NSD2O96028 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NSD2O96028 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NSD2O96028 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NSD2O96028 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NSD2O96028 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NSD2O96028 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NSD2O96028 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NSD2O96028 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NSD2O96028 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NSD2O96028 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NSD2O96028 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NSD2O96028 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NSD2O96028 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NSD2O96028 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NSD2O96028 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NSD2O96028 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NSD2O96028 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NSD2O96028 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NSD2O96028 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NSD2O96028 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NSD2O96028 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NSD2O96028 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NSD2O96028 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NSD2O96028 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NSD2O96028 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NSD2O96028 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NSD2O96028 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NSD2O96028 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NSD2O96028 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NSD2O96028 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NSD2O96028 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NSD2O96028 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NSD2O96028 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NSD2O96028 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NSD2O96028 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NSD2O96028 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NSD2O96028 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NSD2O96028 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NSD2O96028 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NSD2O96028 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NSD2O96028 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NSD2O96028 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NSD2O96028 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NSD2O96028 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NSD2O96028 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NSD2O96028 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NSD2O96028 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NSD2O96028 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NSD2O96028 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NSD2O96028 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NSD2O96028 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NSD2O96028 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NSD2O96028 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NSD2O96028 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NSD2O96028 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NSD2O96028 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NSD2O96028 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NSD2O96028 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NSD2O96028 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NSD2O96028 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NSD2O96028 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NSD2O96028 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NSD2O96028 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NSD2O96028 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NSD2O96028 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NSD2O96028 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NSD2O96028 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NSD2O96028 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NSD2O96028 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NSD2O96028 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NSD2O96028 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NSD2O96028 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NSD2O96028 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NSD2O96028 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NSD2O96028 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NSD2O96028 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NSD2O96028 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NSD2O96028 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NSD2O96028 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NSD2O96028 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NSD2O96028 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NSD2O96028 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NSD2O96028 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NSD2O96028 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NSD2O96028 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NSD2O96028 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NSD2O96028 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NSD2O96028 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NSD2O96028 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NSD2O96028 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NSD2O96028 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms