Protein–RNA interactions for Protein: O95749

GGPS1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1O95749 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGPS1O95749 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGPS1O95749 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGPS1O95749 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGPS1O95749 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGPS1O95749 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGPS1O95749 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGPS1O95749 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGPS1O95749 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGPS1O95749 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGPS1O95749 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGPS1O95749 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGPS1O95749 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGPS1O95749 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGPS1O95749 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGPS1O95749 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGPS1O95749 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGPS1O95749 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGPS1O95749 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGPS1O95749 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGPS1O95749 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGPS1O95749 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGPS1O95749 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGPS1O95749 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms