Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD4O95243 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD4O95243 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD4O95243 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MBD4O95243 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MBD4O95243 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MBD4O95243 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MBD4O95243 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MBD4O95243 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MBD4O95243 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MBD4O95243 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MBD4O95243 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MBD4O95243 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MBD4O95243 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MBD4O95243 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MBD4O95243 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MBD4O95243 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MBD4O95243 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MBD4O95243 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MBD4O95243 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MBD4O95243 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MBD4O95243 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MBD4O95243 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MBD4O95243 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MBD4O95243 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MBD4O95243 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MBD4O95243 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MBD4O95243 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MBD4O95243 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MBD4O95243 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MBD4O95243 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MBD4O95243 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MBD4O95243 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MBD4O95243 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MBD4O95243 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MBD4O95243 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MBD4O95243 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MBD4O95243 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MBD4O95243 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MBD4O95243 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MBD4O95243 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MBD4O95243 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MBD4O95243 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MBD4O95243 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MBD4O95243 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MBD4O95243 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MBD4O95243 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MBD4O95243 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MBD4O95243 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MBD4O95243 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MBD4O95243 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MBD4O95243 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MBD4O95243 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MBD4O95243 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MBD4O95243 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MBD4O95243 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MBD4O95243 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MBD4O95243 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MBD4O95243 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MBD4O95243 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MBD4O95243 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MBD4O95243 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MBD4O95243 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MBD4O95243 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MBD4O95243 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD4O95243 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD4O95243 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD4O95243 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD4O95243 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD4O95243 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD4O95243 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD4O95243 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD4O95243 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD4O95243 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD4O95243 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD4O95243 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD4O95243 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD4O95243 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD4O95243 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD4O95243 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD4O95243 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD4O95243 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD4O95243 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD4O95243 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD4O95243 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD4O95243 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD4O95243 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD4O95243 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD4O95243 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD4O95243 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD4O95243 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD4O95243 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD4O95243 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD4O95243 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD4O95243 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD4O95243 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD4O95243 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD4O95243 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD4O95243 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD4O95243 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms