Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
VAMP4O75379 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms