Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms