Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNAB3O43448 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNAB3O43448 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNAB3O43448 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNAB3O43448 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNAB3O43448 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNAB3O43448 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNAB3O43448 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNAB3O43448 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNAB3O43448 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNAB3O43448 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNAB3O43448 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNAB3O43448 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNAB3O43448 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNAB3O43448 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNAB3O43448 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNAB3O43448 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNAB3O43448 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNAB3O43448 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNAB3O43448 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNAB3O43448 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNAB3O43448 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNAB3O43448 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms