Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSI1O43347 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSI1O43347 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSI1O43347 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MSI1O43347 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSI1O43347 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSI1O43347 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSI1O43347 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MSI1O43347 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MSI1O43347 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MSI1O43347 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MSI1O43347 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MSI1O43347 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MSI1O43347 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MSI1O43347 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSI1O43347 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSI1O43347 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSI1O43347 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSI1O43347 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSI1O43347 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSI1O43347 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSI1O43347 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSI1O43347 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSI1O43347 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSI1O43347 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSI1O43347 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSI1O43347 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSI1O43347 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSI1O43347 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSI1O43347 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSI1O43347 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MSI1O43347 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSI1O43347 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSI1O43347 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSI1O43347 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSI1O43347 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSI1O43347 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSI1O43347 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSI1O43347 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSI1O43347 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSI1O43347 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MSI1O43347 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSI1O43347 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MSI1O43347 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSI1O43347 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSI1O43347 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSI1O43347 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSI1O43347 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSI1O43347 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSI1O43347 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSI1O43347 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSI1O43347 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSI1O43347 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSI1O43347 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSI1O43347 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MSI1O43347 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSI1O43347 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSI1O43347 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSI1O43347 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSI1O43347 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSI1O43347 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MSI1O43347 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MSI1O43347 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSI1O43347 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSI1O43347 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSI1O43347 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSI1O43347 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MSI1O43347 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSI1O43347 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSI1O43347 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSI1O43347 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSI1O43347 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSI1O43347 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSI1O43347 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSI1O43347 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSI1O43347 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSI1O43347 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MSI1O43347 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSI1O43347 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MSI1O43347 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSI1O43347 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSI1O43347 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSI1O43347 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MSI1O43347 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSI1O43347 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MSI1O43347 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSI1O43347 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSI1O43347 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSI1O43347 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSI1O43347 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSI1O43347 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MSI1O43347 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSI1O43347 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSI1O43347 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MSI1O43347 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSI1O43347 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSI1O43347 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSI1O43347 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSI1O43347 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSI1O43347 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms