Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms