Protein–RNA interactions for Protein: O15259

NPHP1, Nephrocystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP1O15259 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP1O15259 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP1O15259 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP1O15259 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP1O15259 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NPHP1O15259 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NPHP1O15259 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NPHP1O15259 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NPHP1O15259 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPHP1O15259 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NPHP1O15259 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms