Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KPNA3O00505 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms