Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PIK3CDO00329 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms