Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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