Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A6NL46 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A6NL46 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A6NL46 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A6NL46 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A6NL46 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A6NL46 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A6NL46 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A6NL46 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A6NL46 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A6NL46 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A6NL46 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A6NL46 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A6NL46 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A6NL46 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
A6NL46 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A6NL46 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A6NL46 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A6NL46 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A6NL46 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
A6NL46 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A6NL46 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
A6NL46 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
A6NL46 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A6NL46 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
A6NL46 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A6NL46 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A6NL46 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
A6NL46 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A6NL46 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A6NL46 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A6NL46 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
A6NL46 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A6NL46 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A6NL46 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A6NL46 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A6NL46 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A6NL46 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A6NL46 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A6NL46 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A6NL46 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A6NL46 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
A6NL46 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A6NL46 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A6NL46 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A6NL46 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A6NL46 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A6NL46 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A6NL46 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A6NL46 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A6NL46 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A6NL46 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A6NL46 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A6NL46 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A6NL46 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A6NL46 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A6NL46 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A6NL46 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A6NL46 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A6NL46 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A6NL46 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A6NL46 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A6NL46 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A6NL46 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A6NL46 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A6NL46 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A6NL46 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A6NL46 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A6NL46 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A6NL46 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A6NL46 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A6NL46 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A6NL46 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A6NL46 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A6NL46 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A6NL46 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A6NL46 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A6NL46 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A6NL46 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A6NL46 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A6NL46 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A6NL46 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A6NL46 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A6NL46 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A6NL46 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A6NL46 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A6NL46 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A6NL46 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A6NL46 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A6NL46 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A6NL46 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A6NL46 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A6NL46 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A6NL46 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A6NL46 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A6NL46 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
A6NL46 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A6NL46 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A6NL46 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A6NL46 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms