Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85CA6NKD9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms