Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms