Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms