Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVM2

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVM2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms