Protein–RNA interactions for Protein: U3KQV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQV3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
U3KQV3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
U3KQV3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
U3KQV3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
U3KQV3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
U3KQV3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
U3KQV3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
U3KQV3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
U3KQV3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
U3KQV3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
U3KQV3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
U3KQV3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
U3KQV3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
U3KQV3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
U3KQV3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
U3KQV3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
U3KQV3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
U3KQV3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
U3KQV3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
U3KQV3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
U3KQV3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
U3KQV3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
U3KQV3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
U3KQV3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
U3KQV3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
U3KQV3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
U3KQV3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
U3KQV3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
U3KQV3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
U3KQV3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
U3KQV3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
U3KQV3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
U3KQV3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
U3KQV3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
U3KQV3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
U3KQV3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
U3KQV3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
U3KQV3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
U3KQV3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
U3KQV3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
U3KQV3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
U3KQV3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
U3KQV3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
U3KQV3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
U3KQV3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
U3KQV3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
U3KQV3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
U3KQV3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
U3KQV3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
U3KQV3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
U3KQV3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
U3KQV3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
U3KQV3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
U3KQV3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
U3KQV3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
U3KQV3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
U3KQV3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
U3KQV3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
U3KQV3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
U3KQV3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
U3KQV3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
U3KQV3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
U3KQV3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
U3KQV3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
U3KQV3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
U3KQV3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
U3KQV3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
U3KQV3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
U3KQV3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
U3KQV3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
U3KQV3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
U3KQV3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
U3KQV3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
U3KQV3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
U3KQV3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
U3KQV3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
U3KQV3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
U3KQV3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
U3KQV3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
U3KQV3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
U3KQV3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
U3KQV3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
U3KQV3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
U3KQV3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
U3KQV3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
U3KQV3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
U3KQV3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
U3KQV3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
U3KQV3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
U3KQV3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
U3KQV3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
U3KQV3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
U3KQV3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U3KQV3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
U3KQV3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U3KQV3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
U3KQV3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
U3KQV3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
U3KQV3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U3KQV3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms