Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CAMTA1Q9Y6Y1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CAMTA1Q9Y6Y1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CAMTA1Q9Y6Y1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CAMTA1Q9Y6Y1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CAMTA1Q9Y6Y1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CAMTA1Q9Y6Y1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CAMTA1Q9Y6Y1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAMTA1Q9Y6Y1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAMTA1Q9Y6Y1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAMTA1Q9Y6Y1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAMTA1Q9Y6Y1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAMTA1Q9Y6Y1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAMTA1Q9Y6Y1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms