Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX9Q9Y5X1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms