Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms