Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms