Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFSF13BQ9Y275 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFSF13BQ9Y275 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFSF13BQ9Y275 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFSF13BQ9Y275 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFSF13BQ9Y275 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFSF13BQ9Y275 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFSF13BQ9Y275 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFSF13BQ9Y275 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFSF13BQ9Y275 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFSF13BQ9Y275 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFSF13BQ9Y275 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFSF13BQ9Y275 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFSF13BQ9Y275 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFSF13BQ9Y275 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFSF13BQ9Y275 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFSF13BQ9Y275 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF13BQ9Y275 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms