Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMC3Q9UQE7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMC3Q9UQE7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms