Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ88

CDK11A, Cyclin-dependent kinase 11A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11AQ9UQ88 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDK11AQ9UQ88 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDK11AQ9UQ88 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDK11AQ9UQ88 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDK11AQ9UQ88 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDK11AQ9UQ88 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDK11AQ9UQ88 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDK11AQ9UQ88 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDK11AQ9UQ88 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDK11AQ9UQ88 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDK11AQ9UQ88 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDK11AQ9UQ88 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDK11AQ9UQ88 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDK11AQ9UQ88 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDK11AQ9UQ88 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDK11AQ9UQ88 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDK11AQ9UQ88 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDK11AQ9UQ88 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDK11AQ9UQ88 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDK11AQ9UQ88 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDK11AQ9UQ88 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDK11AQ9UQ88 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDK11AQ9UQ88 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDK11AQ9UQ88 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDK11AQ9UQ88 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDK11AQ9UQ88 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CDK11AQ9UQ88 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CDK11AQ9UQ88 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CDK11AQ9UQ88 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CDK11AQ9UQ88 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CDK11AQ9UQ88 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CDK11AQ9UQ88 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CDK11AQ9UQ88 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDK11AQ9UQ88 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDK11AQ9UQ88 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDK11AQ9UQ88 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CDK11AQ9UQ88 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDK11AQ9UQ88 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDK11AQ9UQ88 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDK11AQ9UQ88 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDK11AQ9UQ88 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDK11AQ9UQ88 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDK11AQ9UQ88 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDK11AQ9UQ88 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDK11AQ9UQ88 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
CDK11AQ9UQ88 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDK11AQ9UQ88 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDK11AQ9UQ88 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
CDK11AQ9UQ88 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDK11AQ9UQ88 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDK11AQ9UQ88 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDK11AQ9UQ88 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDK11AQ9UQ88 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDK11AQ9UQ88 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms