Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms