Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIAA1024Q9UPX6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms