Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TRIM35Q9UPQ4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM35Q9UPQ4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms