Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms