Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP45Q9UL16 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP45Q9UL16 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms