Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms