Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms